Магнитно-резонансная томография пусть и является очень важным и распространенным методом исследования человека в современной медицине, но у этого метода есть ряд противопоказаний. Их принято разделять на условные и те, при которых проведение такого обследования совершенно недопустимо. К последним относятся такие моменты как, например, наличие в теле человека различных имплантатов или же стимуляторов (например, кардиостимулятор); подобное может повлиять на ход обследования и его результат. К условным противопоказаниям относятся наличие у больного клаустрофобии, сердечной недостаточности, перенесенные ранее операции на сердце с установкой клапанов, а также общее состояние больного (критическое, буйно-неадекватное и так далее).